男性不育癥的男科治療是通過手術方法去除造成男性不育的病因，主要有以下幾種類型的手術：

提高睪丸生理功能的男科療法包括精索靜脈曲張手術、隱睪牽引固定術以及睪丸移植術等。

輸精道梗阻的男科治療采用男科手術方法，解除輸精道梗阻而導致的不育。近年來，男性生殖道梗阻的男科治療逐漸受到重視，治療方法包括輸精管附睪吻合術、輸精管吻合術及射精管口梗阻經尿道電切開術等。經過上述治療后，部分男性不育者可出現精子排出，但仍有許多患者不能恢復精子排出。對長段輸精管梗阻或發育不全，有人采用睪丸異質精液囊腫術。

有些不育男性睪丸和附睪正常，但體檢發現有輸精管精囊缺如，或伴有精囊部位梗阻，例如結核后、盆腔手術后或先天性異常等。對于這些患者，有人采用由硅膠制成的儲精囊種植于皮下，將其連接于附睪管，然后穿刺人工儲精囊內的精液進行人工授精。

射精管口閉塞是造成梗阻性無精癥的原因之一，其病因有淋病、非特異性尿道炎等炎性粘連或前列腺囊腫、巨大前列腺小囊壓迫射精管口。手術采用尿道鏡下后尿道縱形切開或精阜切除，術中看到經輸精管注人的靛胭脂在手術野中出現證明手術已較徹底，同時應注意避免直腸和尿道括約肌損傷。術后約45%-60%患者精液質量改善，妊娠率約29%一35%。